Programe naționale de genomică în Europa: lecții pentru Moldova

În ultimii cincisprezece ani, mai multe țări europene au transformat genomica dintr-o activitate de cercetare într-o infrastructură națională. Nu toate au procedat la fel. Regatul Unit a secvențiat pacienți pentru diagnosticarea bolilor rare și a cancerului. Estonia și Finlanda au genotipat o parte importantă a populației și au legat rezultatele de dosarele naționale de sănătate. Danemarca a creat un centru național pentru a introduce secvențierea întregului genom în îngrijirea medicală de rutină. Programul Național de Digitalizare a Sistemului de Sănătate (2025–2030) al Republicii Moldova prevede screeningul a aproximativ 1% din populație, adică circa 24.000 de genomi. Fiecare dintre cele patru modele oferă lecții despre cum poate fi proiectat acest screening.

Regatul Unit: 100,000 Genomes Project

100,000 Genomes Project (Proiectul 100.000 de genomi) a fost anunțat de guvernul britanic la sfârșitul anului 2012 și derulat de Genomics England. În cadrul lui au fost secvențiate 100.000 de genomuri întregi de la pacienți ai NHS: peste 85.000 de participanți cu boli rare sau cancer și, în cazurile de boli rare, adesea și rudele acestora. Al 100.000-lea genom a fost secvențiat în decembrie 2018.

Proiectul a fost conceput de la început în jurul îngrijirii clinice. Un studiu pilot publicat în New England Journal of Medicine în 2021 a cuprins 4.660 de participanți din 2.183 de familii, cu 161 de boli rare. Acesta a stabilit un diagnostic genetic la 25% dintre probanzi. Ratele de diagnostic au fost mult mai mari pentru bolile cu probabilă cauză monogenică (35%) decât pentru cele cu probabilă cauză complexă (11%). Dintre diagnosticele stabilite, 25% au avut consecințe imediate asupra deciziilor clinice pentru pacienți sau rudele lor. Aproximativ 14% dintre diagnostice au necesitat o combinație de analiză automată și analiză de cercetare, adesea pentru a identifica variante pe care secvențierea exomului le-ar fi omis.

Rezultatele proiectului alimentează acum NHS Genomic Medicine Service (Serviciul de medicină genomică al NHS), care oferă testarea genomică ca parte a îngrijirii de rutină. Cercetătorii au acces la datele pentru care s-a dat consimțământul doar prin canale aprobate.

Estonia: o biobancă populațională legată de dosarele naționale

Biobanca Estonă (Estonian Biobank), administrată de Institutul de Genomică al Universității din Tartu, urmează un alt model. Voluntari din populația adultă generală s-au înscris pe baza unui consimțământ larg, reglementat de Legea estonă privind cercetarea genelor umane (Human Genes Research Act). Biobanca are în prezent peste 210.000 de participanți, aproximativ 20% din populația adultă a Estoniei. Toți au fost genotipați pe un microarray cu peste 700.000 de markeri, iar câteva mii au genomul întreg secvențiat.

Valoarea biobăncii provine din legarea datelor. Datele participanților sunt actualizate periodic din bazele de date electronice și registrele naționale de sănătate ale Estoniei, pe baza sistemului național de e-sănătate. Acest lucru le permite cercetătorilor să studieze bolile, prescripțiile și rezultatele pe parcursul multor ani și să recheme participanții pentru urmărire.

Estonia a mers, de asemenea, mai departe decât majoritatea țărilor în comunicarea rezultatelor către participanți. Proiectele pilot privind cancerul mamar și bolile cardiovasculare au oferit feedback genetic pentru peste 2.000 de participanți. În iunie 2024, biobanca a lansat portalul MyGenome (MinuGeenivaramu). Participanții se autentifică cu cartea de identitate, Mobile-ID sau Smart-ID pentru a-și vedea riscul poligenic pentru diabetul de tip 2 și boala coronariană, rapoartele farmacogenetice și informațiile despre origine.

Finlanda: FinnGen și avantajul unei populații izolate genetic

FinnGen, condus de Universitatea din Helsinki împreună cu toate biobăncile publice finlandeze și având parteneri din industrie printre finanțatori, și-a propus să combine datele genomice a 500.000 de finlandezi cu datele din registrele naționale de sănătate. Setul final de date a fost pus la dispoziție intern în septembrie 2023 și public în noiembrie 2024. Acesta cuprinde 500.348 de persoane, aproximativ 10% din populația Finlandei, legate de date din registre pe parcursul întregii vieți, inclusiv diagnostice, prescripții și cauze ale decesului.

Istoria populației Finlandei face ca unele variante cauzatoare de boli să fie concentrate la frecvențe mai mari decât în restul Europei, ceea ce le face mai ușor de studiat. O analiză din 2023 publicată în Nature, pe 224.737 de participanți FinnGen, a raportat 2.733 de asocieri semnificative la nivelul întregului genom pentru 1.932 de criterii finale de boală. FinnGen a recrutat, de asemenea, în mare măsură prin biobăncile spitalelor, astfel încât cohorta este mai vârstnică și mai bogată în boli decât un eșantion din populația generală. Rezultatele sintetice sunt disponibile public cercetătorilor din întreaga lume.

Danemarca: un centru genomic național în interiorul sistemului de sănătate

Danemarca a adoptat în 2017 o strategie națională pentru medicina personalizată, a actualizat-o în 2021 și a înființat în 2019 Centrul Național Danez de Genomică (Danish National Genome Center). Centrul oferă o infrastructură națională comună: un centru de secvențiere a întregului genom, un centru de calcul de înaltă performanță și o bază națională de date genomice pentru clinicieni și cercetători.

În decembrie 2018, Novo Nordisk Foundation a angajat 990 de milioane DKK pe o perioadă de patru ani și jumătate pentru construirea infrastructurii, cu așteptarea ca aproximativ 60.000 de persoane să beneficieze de secvențierea întregului genom în primii cinci ani. Copiii și tinerii cu boli rare s-au numărat printre primele grupuri de pacienți selectate. Spre deosebire de o biobancă de cercetare, modelul danez este clinic: pacienții sunt secvențiați pentru că îngrijirea lor o impune, iar datele rămân într-o infrastructură națională, guvernată public.

Ce au în comun cele patru modele

Program	Obiectiv principal	Tehnologie principală	Legătura cu îngrijirea medicală
Genomics England	Diagnosticarea bolilor rare și a cancerului	Secvențierea întregului genom	Prin traseele clinice ale NHS
Biobanca Estonă	Cercetare populațională și prevenție personalizată	Microarray-uri de genotipare, parțial secvențiere	Dosarele naționale de e-sănătate; portal de rezultate
FinnGen	Descoperiri genetice legate de registre, cu parteneri din industrie	Genotipare	Registrele naționale de sănătate (cercetare)
Centrul Național Danez de Genomică	Secvențiere clinică în îngrijirea de rutină	Secvențierea întregului genom	Direct în cadrul sistemului public de sănătate

Se disting trei tipare. În primul rând, fiecare program și-a ales un scop principal clar, iar acest scop a determinat cine a fost inclus și ce tehnologie a fost folosită. În al doilea rând, valoarea a provenit din legarea genomurilor de dosarele de sănătate, fie că este vorba de datele NHS, de sistemul de e-sănătate al Estoniei sau de registrele nordice. În al treilea rând, fiecare program a investit în guvernanță: legislație specifică sau modele de consimțământ, acces controlat la date și infrastructură găzduită la nivel național.

Lecții pentru un screening de 24.000 de genomi în Republica Moldova

Programul Republicii Moldova, care acoperă aproximativ 2,36 milioane de persoane, este mai apropiat ca scară de Estonia decât de Regatul Unit. Obiectivul său declarat, screeningul și farmacogenomica, se situează de asemenea între modelul populațional și cel clinic. De aici rezultă câteva lecții:

1. Definiți mai întâi utilizarea clinică. Screeningul pentru afecțiuni care permit intervenție, profilarea farmacogenomică și descoperirile din cercetare necesită strategii diferite de eșantionare. Un design mixt este posibil, dar fiecare componentă are nevoie de propriul protocol.
2. Alegeți tehnologia potrivită scopului. Cercetătorii estonieni au constatat că microarray-urile de genotipare au performanțe similare cu secvențierea genomului pentru predicțiile farmacogenetice, la un cost mult mai mic, iar microarray-urile stau la baza marilor cohorte populaționale din Estonia și Finlanda. Secvențierea întregului genom, ca în Regatul Unit și Danemarca, este cea mai valoroasă pentru diagnosticarea pacienților cu suspiciune de boală rară.
3. Construiți legătura cu DES. Având în vedere că acoperirea cu dosarul electronic de sănătate (DES) este planificată să crească de la sub 10% la 80% până în 2030, rezultatele genomice ar trebui stocate într-o formă structurată și codificată, pe care dosarul național și sistemele de suport decizional să o poată folosi.
4. Planificați comunicarea rezultatelor. Abordarea graduală a Estoniei, de la feedback-ul din proiectele pilot, însoțit de consiliere genetică, la un portal securizat cu consimțământ dinamic, este un model realist. Capacitatea de consiliere trebuie planificată în paralel cu capacitatea de secvențiere.
5. Creați o referință pentru Republica Moldova. Frecvențele variantelor diferă de la o populație la alta. Un set național de date îmbunătățește interpretarea fiecărui test ulterior, așa cum a arătat FinnGen pentru Finlanda.
6. Păstrați suveranitatea datelor. Centrul național de calcul al Danemarcei amintește că analiza genomică este solicitantă din punct de vedere computațional. Cerința Republicii Moldova ca datele medicale să rămână în țară înseamnă că alinierea, identificarea variantelor (variant calling) și analiza ar trebui să ruleze pe capacitate de calcul dedicată, de nivel enterprise, găzduită în Republica Moldova.

Lecturi și soluții conexe

• Genomică: screening populațional și farmacogenomică
• Farmacogenomica în practica clinică
• Farmacologie și planuri de tratament
• Infrastructură de IA suverană, on-premise
• Suveranitatea datelor medicale: GDPR, EHDS și Regulamentul UE privind IA (AI Act)

Proiectați un screening genomic sau un traseu de farmacogenomică? Contactați Import Medical pentru a discuta fluxurile de secvențiere, integrarea datelor și analiza în interiorul țării.

program național de genomică Genomics England Biobanca Estonă FinnGen Republica Moldova

Surse

1. The 100,000 Genomes Project — Genomics England
2. 100,000 Genomes Pilot on Rare-Disease Diagnosis in Health Care — Preliminary Report — New England Journal of Medicine
3. Estonian Biobank — Institute of Genomics, University of Tartu
4. Results based on the full FinnGen cohort of 500,000 participants released — FinnGen
5. Novo Nordisk Foundation supports new National Genome Centre — Novo Nordisk Foundation
6. At least 60,000 Danish patients are offered a genetic test — Aarhus University, Department of Biomedicine